法律分析：借款人在发现借款协议存在瑕疵时，可以向提起诉讼，但需满足一定条件。
法律依据：
1.《合同法》第九条：合同的当事人应当遵循诚实信用原则，履行自己的义务，维护合同的平等、自愿原则。
2.《合同法》第十二条：当事人订立合同，应当遵循公平原则，不得损害国家利益、社会公共利益，不得违背公序良俗。
3.《合同法》第十四条：当事人订立合同，应当遵循自愿原则和等价原则，不得强迫对方订立或者变更合同，不得恶意制造、利用形式障碍使对方无法行使权利或者履行义务。
4.《民法典》第一千零二十四条：合同一经订立，当事人应当按照约定履行义务。
根据以上法律依据，若借款协议存在瑕疵，如违反公平原则、损害国家利益等，借款人可以向提起诉讼要求变更或解除合同。但若借款协议只是因为合同条款不公平或合同内容不明确等原因，且没有违反法律法规，借款人提起的诉讼可能难以获得胜诉。
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